Mannelijke onvruchtbaarheid kan zich voordoen wanneer het lichaam niet voldoende testosteron of gonadotrofinen (FSH en LH) produceert. Sperma met een lagere kwaliteit door hormonale stoornissen is eerder zeldzaam. Zo wordt bijvoorbeeld bij sportmensen op een hoog niveau de vruchtbaarheid aangetast omdat ze hun toevlucht nemen tot bepaalde vormen van doping met hormonen (in bepaalde gevallen kan dit fenomeen verdwijnen zodra de doping wordt stopgezet).
Deze hormonale stoornis is gelinkt aan afscheidingsproblemen van verschillende klieren zoals de hypothalamus, de hypofyse, de schildklier of de teelballen.